Optimización Geometría - Gaussian análisis *.out *.log orbitales moleculares MOLEKEL AVOGADRO VMD

Optimización de Geometría - Gaussian análisis archivo.out archivo.log orbitales moleculares MOLEKEL AVOGADRO y VMD

En el vídeo les muestro como podemos analizar los resultados obtenidos de una optimización de geometría, en ocasiones sucede que no contamos con el programa gaussview para visualizar el archivo de salida (*.out o *.log) y tenemos que recurrir a otras herramientas para esto, como él es caso de Molekel, Avogadro y VMD, con estos programas podemos hacer el análisis de los resultados aunque con varias restricciones, pero dentro de lo que podemos hacer es bueno además son alternativas libre o gratis, y aquí les muestro una parte de los que se puede hacer con estas herramientas, cabe mencionas que es necesario conocer más acerca de los alcances de cada programa para poder implementar cualquiera de los programas, ya que cada uno tiene un fin especifico, y otros ya no tienen soporte como Molekel, el archivo de salida del Gaussian puede ser un *.log o *.out tiene la misma información, y en la corrida se deben usar las palabras claves y generar el archivo *.chk donde se guarda información sobre la distribución de los electrones, el archivo chk lo usamos para crear el archivo *.fchk que lo puede leer cualquier gaussview y Avogadro y a partir de este generar los archivos *.cube, con los programas formchk.exe y cubegen.exe estos se encuentran en la carpeta de g09 (en mi caso) del sistema de Windows, este procedimiento lo realice en Windows, ya que en Linux es más probable que los programas fallen, por “x” motivo, aunque si se puede porque los mismos programas están Linux a excepción de formchk.exe y cubegen.exe (no estoy muy seguro), les dejo el archivo en MEGA, un saludo.

Si tienes alguna duda o comentario contácteme al correo siguiente
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Molekel (ya no tiene soporte)
https://ugovaretto.github.io/molekel/
https://ugovaretto.github.io/molekel/...
Avogadro (es el programa que descargas de ORCA, requiere registro)
https://orcaforum.kofo.mpg.de/app.php...

VMD (requiere registro)
https://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/
Archivo del procedimiento
https://mega.nz/file/T5cAwSgJ#0TFjYdx...

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