Скачать или смотреть APOBEC3G

APOBEC3G, by Wikipedia https://ja.wikipedia.org/wiki?curid=4... / CC BY SA 3.0

#EC_3.5.4
APOBEC3G（apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide-like 3G; アポリポプロテインB mRNA編集酵素、触媒ポリペプチド様3G）は、ヒトのAPOBEC3G遺伝子によってコードされる酵素でありAPOBECファミリー蛋白の一種である。
APOBECファミリー蛋白は自然免疫において重要な役割を果たすことが示唆されている。
APOBEC3Gはシチジンデアミナーゼの一種であり、一本鎖DNAに作用してシチジンをウリジンに変換(脱アミノ化)する反応を触媒する。
APOBEC3GのC末端ドメインが触媒活性を付与しているが、これはNMR(核磁気共鳴)および結晶構造が基質特異性や触媒活性を示していることからも分かる。
APOBEC3Gはウイルス複製を阻害することによりレトロウイルス(特にHIV)に対して自然免疫活性を示す。
しかし、HIVなどのレンチウイルスはこの影響を打ち消すためにウイルス感染因子タンパク質（Vif）を進化させた。
VifはAPOBEC3Gと相互作用し、プロテアソームを介したAPOBEC3Gのユビキチン化と分解を引き起こす。
一方、フォーミーウイルスはアクセサリータンパク質のBet（P89873）を産生するが、それはAPOBEC3Gの細胞質溶解性を阻害する性質を持つ。
BetとVifは異なる分子機序であるがAPOBEC3Gを抑制するという点は同じである。
そのため、フォーミーウイルスのBet遺伝子をVif遺伝子に置き換えたウイルスを作成すると、Betの代わりにVIfが働いてAPOBEC3を抑制し、組み換えウイルスは感染複製能を維持する。
APOBEC3Gは2002年にJarmuzらによって初めて発見され、22番染色体上のタンパク質APOBEC3A～Gのファミリーの仲間であることがわかった。
その後ウイルスアクセサリータンパク質Vifを欠くHIV-1の複製を制限することができる細胞因子であると分かった。
そしてその後すぐに、APOBEC3GはシチジンデアミナーゼのAPOBEC1との相同性が認められたため、同じAPOBECファミリー蛋白の仲間であることが明らかとなった。
APOBEC3Gは対称構造を持っており、2つの相同な触媒領域、すなわちN末端領域（CD1）とC末端領域（CD2）がある。
CD1、CD2のそれぞれに亜鉛イオンが含まれている。
また、各領域は、シチジンデアミナーゼの典型的なHis / Cys-X-Glu-X23–28-Pro-Cys-X2-Cysモチーフを有している。
しかし、典型的なシチジンデアミナーゼとは異なり、APOBEC3Gは触媒内の2つのベータシートの間に固有のアルファヘリックスを有している。
このアルファヘリックスが補酵素結合部位となり得る。
(図1) CD2は触媒的としてアクティブであり、脱アミノ化と基質結合部位(モチーフ)の構造的特異性に不可欠である。
CD1は触媒として非アクティブであるが、DNAおよびRNAへの結合にとって非常に重要であり、APOBEC3G脱アミノ化の5 '→ 3'の処理能力の原動力である。
また、CD2はCD1が存在しないとデアミナーゼ活性を持たない。
生体内のAPOBEC3Gは、単量体、2量体、3量体、4量体、および高次のオリゴマーで構成されている。
APOBEC3Gは2量体として機能すると考えられているが、実際には単量体とオリゴマーの混合物として機能する可能性がある。
APOBEC3Gの128番目のアミノ酸残基はD(アスパラギン酸)であり、CD1 (図1)に含まれる。
これが K (リシン)に変異 (D128K) した APOBEC3G が Vifによる変性を免れることが分かっており、両者の相互作用において特に重要であるらしい。
さらに、APOBEC3Gのアミノ酸残基128は、負に帯電したモチーフを形成する。
そのモチーフはVifとの相互作用およびAPOBEC3G-Vif複合体の形成に重要である。
また、残基124-127は、APOBEC3GのHIV-1粒子内への取り込みおよびその結果として生じる抗レトロウイルス活性にとって重要である。
APOBEC3Gは広く研究されており、HIV-1複製に悪影響を及ぼすいくつかのメカニズムが同定されている。
APOBEC3Gおよび同じファミリーの他のタンパク質は、活性化誘導（シチジン）デアミナーゼ（AID）として機能できる。
APOBEC3Gが逆転写を阻...