Скачать или смотреть Holland Onion - Percée scientifique de l'oignon holandais

Une tâche gigantesque vient d'être achevée ! Près de 20 ans après le génome humain, des scientifiques néerlandais ont réussi à décoder intégralement l'ADN de l'oignon.

L'ADN de l'oignon s'avère vaste, complexe et mystérieux...
Les 3 milliards de « lettres » de l'ADN du génome humain étaient déjà époustouflants - mais le modeste oignon en a quelque 16 milliards. Cela fait plus de 10 mètres linéaires d'ADN, curieusement plié dans chaque cellule d'oignon !

Cinq fois plus gros que le génome humain
Le génome de l'oignon est donc étonnamment grand. Sous la direction inspirante de Finkers et Scholten, une mission révolutionnaire a été accomplie : le secret du génome de l'Allium cepa a été percé !

Les scientifiques du génome
Dr. Ing. Richard Finkers est chercheur en génomique et applications Big Data and Dr. Ing. Olga Scholten est chercheuse spécialiste de l'Allium. Ces deux scientifiques sont employés par le prestigieux Wageningen UR et sont experts en sélection végétale.

Le séquençage de novo
Scholten et Finkers ont choisi comme objet d'étude un oignon désigné par le code DHCU066619.
Cette lignée, dite DH, a été développée pour transformer l'Allium cepa diploïde hétérozygote en diploïde homozygote. Sans cette duplication, le séquençage de novo aurait été pratiquement impossible.

Appareil de lecture d'ADN révolutionnaire
Mais c'est aussi la formidable accélération de la technologie des capteurs d'ADN qui a permis le séquençage intégral du génome de l'oignon. Plusieurs séquenceurs ont été utilisés. La nouvelle technologie nanopore, une mini cartouche contenant en solution toutes les substances nécessaires pour lire une molécule d'ADN, a révolutionné le processus de séquençage.

Nanopores
Avec 8 000 nanopores par cartouche, l'appareil peut lire au moins 400 000 bases par seconde !
La version miniature de ce séquenceur d'ADN révolutionnaire, le minION, peut être branchée en fonctionnement sur un ordinateur portable, pour permettre la visualisation sur écran en temps réel.

Savoir-faire évolutif
La révélation de la séquence des gènes de l'oignon va faire avancer les connaissances de base des processus biologiques. Elle fournira aussi des informations sur l'évolution des variétés sauvages et des ancêtres de l'oignon moderne.

Champs d'oignons chauds
Grâce à la séquence, il est désormais possible d'identifier rapidement les gènes, notamment ceux responsables de la résistance aux maladies et aux ravageurs ou d'une meilleure absorption des nutriments. Autant de facteurs clés pour une production suffisante d'oignons à l'avenir. Malgré la croissance démographique et l'impact toujours plus manifeste du changement climatique - aussi sur la culture des oignons.

Les chercheurs du monde entier peuvent désormais travailler avec le code source de l'oignon glorieux, publié en ligne.