Скачать или смотреть ¿Cómo instalar PyGBe en Ubuntu 18.04? / Install PyGBe in Ubuntu 18.04

Comandos para instalar pygbe en Ubuntu 18.04



sudo apt update

nvidia-smi

python --version

bash Anaconda3-2020.02-Linux-x86_64.sh

gcc --version

sudo sh cuda_11.0.1_450.36.06_linux.run --override

sudo apt install swig python3-pip python3-numpy python3-scipy python3-matplotlib python3-pandas python3-simpy python3-nose python3-pycuda python3-pytools git

reboot

cd $home

mkdir src

cd src

git clone https://github.com/pygbe/pygbe.git

cd pygbe

sudo python3 setup.py install clean

conda create -n pygbe python=3.7 numpy scipy swig matplotlib

source activate pygbe



Pygbe se ejecuta desde terminal y el nombre del folder con los archivos de la proteina ejemplo:


pygbe lys


Nota si la tarjeta gráfica no soporta un driver superior, es mejor no instalarlo. Cada vez que se modifique el driver hay que reinstalar pycuda