DSDP：GPU加速的高性能盲对接方法 - 张宏博士

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虚拟筛选是药物开发过程中发现先导化#合物的重要步骤，也是缩短药物开发周期和降低成本的关键。在传统的虚拟筛选任务中，靶点蛋白的药物筛选位点大部分是已知的，由该蛋白与配体的共晶结构获得。然而，随着蛋白质三维结构预测方法的蓬勃发展，越来越多不包含配体信息的蛋白质结构被预测出来。因此，在没有已知结合位点的情况下，仅基于蛋白质结构进行高精度的分子对接是非常必要的。针对这个问题，高毅勤教授团队开发了GPU加速的高性能盲对接方法DSDP，该方法结合传统算法与机器学习的优势，与AutoDock Vina和DiffDock等分子对接程序相比，该方法在盲对接的速度与精度上均有显著提升。
原文链接：
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs....
代码链接：
https://github.com/PKUGaoGroup/DSDP.git

张宏博士, 关注分子对接方法的开发与应用，包括蛋白结合位点的预测、蛋白质与小分子的构象采样，相互作用评估等。

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